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植物染色體核型分析
(三圖兩表)


 

軟件界面

報告樣張

染色體自動識別圖像分析系統

    國聯在線M99系列醫學圖象工作站之染色體自動識別,使當前發展比較迅速的細胞遺傳學實驗室技術與計算機先進的自動識別技術相結合,為簡化實驗室煩瑣操作而研制的新一代染色體自動識別系統。它避免了人工攝影、沖洗、放大、剪切等繁雜的人工配對工作,實現了染色體核型分析的自動化、智能化。染色體自動識別系統操作方便,識別率高,是一套先進的診斷、教學工具。

一. 硬件配套設備:

  1. C型接口三目顯微鏡,可以接入CCD視頻采集設備。
  2. 視頻采集設備CCD,數碼相機等。
  3. 視頻傳輸線:復合視頻線,同軸電纜。
  4. 帶RS232接口的計算機。
  5. 視頻采集卡,安裝在計算機的PCI插槽。
  6. SenseLock USB軟件加密鎖。
  7. 彩色噴墨打印機。

二. 軟件運行環境:

  1. Windows 2000,Windows XP以上版本簡體中文操作系統。
  2. 單機版文件數據庫:Microsoft Access 2000及以上版本,Microsoft SQL Server 2000網絡版數據庫及以上版本。
  3. 正確安裝采集卡驅動,加密鎖驅動。

三. 工作流程:

  1.  顯微鏡下圖像,經過CCD視頻采集,視頻信號通過視頻線,輸入視頻采集卡,系統軟件通過視頻采集驅動程序,將動態視頻實時顯示在計算機的顯示器上。
  2. 建立檢驗報告。
  3. 凍結視頻圖像,采集典型染色體分裂相圖像,存入報告中。
  4. 根據分裂相圖像,結合鏡下圖像,進行染色體核型分析(自動和手動兩種方式)和FISH(染色體熒光原位雜交)圖像合成。
  5. 編輯報告,填寫必要的檢驗數據。
  6. 將報告存入數據庫中。
  7. 設置報告格式,打印完整的彩色圖文報告。

四. 主要功能:

  1. 支持同時建立多個數據庫,每個數據庫中的報告數量,只受計算機硬盤容量限制。
  2. 可以對每個數據庫設置口令。
  3. 可以根據報告日期、報告數據項查詢報告。
  4. 查詢結果可以存為報表,方便用戶生成日報和月報等報表,或工作量統計表。
  5. 在每個報告中可以存入的典型圖像,沒有幅數限制。
  6. 可以對圖像進行多種方式的編輯,如灰化,反色,鏡像,銳化,平滑,放大,10多種濾鏡,可以調節紅綠藍色彩比例,可以調節色調飽和度亮度對比度,可以對紅綠藍通道進行曲線調節。
  7. 對每步圖像編輯進行了記憶,可以撤銷或恢復圖像編輯操作。
  8. 可以在每幅圖像上加入多個標注。標注方式含文字和圖形。
  9. 編輯報告時,回車即可切換輸入焦點,方便操作者快速錄入。
  10. 圖像可以存為BMP格式,以及GIF和JPG壓縮圖像格式。圖像質量參數可調。
  11. 視頻質量參數如色調、飽和度、亮度、對比度等參數可調。
  12. 在自動識別染色體后,可以方便地進行粘連和重疊染色體的分割:點擊一次鼠標,即可完成。
  13. 對于特殊的粘連和重疊染色體,可以用手工畫線的方式,完成分割。
  14. 可以拾取未能自動識別的染色體,可以手動修剪染色體輪廓邊界。
  15. 可以去除染色體分裂相圖像的背景和雜質。
  16. 可以設置某個染色體為異常染色體,在檢驗報告中,打印在核型圖下方。
  17. 可以顯示帶紋數據,可以將核型與標準模式圖進行對照。
  18. 可以全自動核型配對,對錯誤的配對,可以通過拖動鼠標進行修改。
  19. 染色體在原始圖像(分裂相圖像)和核型圖像中的位置,可以一一對應,在核型圖中點擊某個染色體,其在原始圖像中的染色體邊界,會出現“流動”現象。
  20. 可對染色體進行拉直和旋轉操作。
  21. 支持三種ISCN標準模式圖:ISCN400,ISCN550,ISCN800。
  22. 可以自定義模式圖:增加帶,刪除帶,修改帶名稱,設置長斷臂、著絲粒位置等。
  23. 在FISH合成時,可以對參與合成的每幅圖像,進行編輯,每個編輯操作都可以撤銷或恢復。
  24. 在FISH合成時,可以調節全部或部分圖像的背景閾值,調節色彩亮度,設置偽彩(如DAPI),將顏色純化,可以舍棄某個顏色分量。
  25. FISH合成后,可以上下左右微調圖像的相對位置,可以加入圖形和文字標注??梢越獸ISH合成圖到處為獨立的圖像文件。
     

FISH功能簡介

  1.  各種顏色熒光圖像采集,無限種顏色添加與修正,無限種顏色信號與圖像合成。
  2.  圖像捕獲時可自動或手動調節曝光時間,放大并捕捉弱熒光信號。
  3. 增強熒光信號,去除背景雜質。
  4. 自動進行熒光信號計數。
  5. 自動或手動測量長度與面積等參數。
  6. 各種注釋。
  7. 圖像和文字資料儲存于專業圖像數據中。
  8. 靈活設置的分析報告內容和格式。
  9. 各種儲存數據的快速檢索。
  10. 可以迅速地獲得探針的精確定位和信號的強度。
  11. 靈活的圖像拍攝程序、控制曝光。
  12. 系統對圖像每個RGB通道的亮度、對比度都可單獨顯示并調整。
  13. 背景均化和顏色信號增強工具操作簡便,可以完成復雜的實時和互動功能。



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